编辑推荐
填补了国内简体中文版Gephi专著空白;
 ;
教读者使用Gephi的基本功能和高级功能;
内容简介
 ;  ; Gephi 是一款网络分析领域的数据可视化处理软件,开发者对它寄予的希望是成为“数据可视化领域的Photoshop”。本书介绍了Gephi 的运行方式及操作方式,可以使读者获得应用Gephi 进行数据可视化的能力。本书简洁明了、通俗易懂、多配图(包括原理示意图、程序运行图、数据可视化图形),既是可视化工具Gephi 的操作手册,也是一本网络科学的入门手册。
 ;  ; 对数据分析、可视化感兴趣的人员、工程技术人员、媒体研究者,以及希望进入数据可视化领域的程序员,都可以通过阅读本书来学习Gephi 的相关知识。
作者简介
刘勇(@ooof)
 ;  ; Gephi中文教程作者,临汾互联网应用推进工作组创建人,分享主义实验室研究员、前NGO 2.0项目志愿者;数据可视化实践者;正在创建一个基于Gephi的规范与标准化网络分析流程的模型,以方便人们更容易地通过Gephi进行网络研究。
目录
第1 章 Gephi 简介 1
1.1 Gephi 是做什么的 2
1.1.1 Gephi 分析怎样的“网络” 2
1.1.2 Gephi 怎样“分析”网络 3
1.2 Gephi 基本情况 3
1.2.1 Gephi 特性 3
1.2.2 Gephi 开发简史 4
1.2.3 Gephi 的基本链接 4
1.3 Gephi 创始人访谈:符号学的重要性 4
第2 章 Gephi 的安装 13
2.1 下载Gephi 14
2.2 安装Gephi 16
2.3 Java 运行时环境管理 20
2.3.1 Gephi 需要Java 运行环境的支持 20
2.3.2 检查Java 版本 21
2.3.3 Java 的下载与安装 22
2.3.4 Java 虚拟机无法启动的处理 26
第3 章 Gephi 的界面与编辑工具 27
3.1 Gephi 的启动界面 28
3.2 Gephi 主界面 29
3.2.1 图窗体 29
3.2.2 4 个编辑工具的位置 30
3.3 4 个编辑工具的基本介绍 31
3.3.1 布局 31
3.3.2 统计 32
3.3.3 外观 32
3.3.4 滤波 32
3.4 Gephi 的整体操作流程 33
第4 章 图窗体的编辑工具和设置工具 35
4.1 图窗体编辑工具 37
4.1.1 全屏显示 38
4.1.2 鼠标选取范围尺寸调整 41
4.1.3 单选 43
4.1.4 矩形选取 44
4.1.5 移动 45
4.1.6 单节点涂色 46
4.1.7 节点大小调整 47
4.1.8 关联节点涂色 49
4.1.9 新建节点 50
4.1.10 新建边 51
4.1.11 节点距离(最短路径) 52
4.1.12 节点范围(距离涂色) 53
4.1.13 节点属性 55
4.2 图窗体设置工具 56
第5 章 数据 66
5.1 Gephi 图形的记录方式 67
5.1.1 图形实例 67
5.1.2 图形在文件中是如何存储的 67
5.1.3 图形在Gephi 数据资料界面中如何记录 68
5.2 数据资料的输入 69
5.2.1 输入节点 69
5.2.2 输入边 71
5.3 CSV 数据的导入与导出 73
5.3.1 节点CSV 数据 74
5.3.2 边CSV 数据 77
5.4 随机图生成 78
5.5 动态数据 80
第6 章 外观 82
6.1 节点 85
6.2 边 89
第7 章 布局 91
7.1 布局的基本操作界面 92
7.2 默认布局 95
7.2.1 Force Atlas 布局 96
7.2.2 Force Atlas 2 布局 97
7.2.3 Fruchterman Reingold 布局 98
7.2.4 Noverlap 布局 98
7.2.5 OpenOrd 布局 99
7.2.6 Rotate 布局 99
7.2.7 Yifan Hu 布局 99
7.2.8 Yifan Hu 比例布局 100
7.2.9 扩展/ 收缩布局 100
7.2.10 标签调整布局 101
7.2.11 随机布局 101
7.3 6 种力引导布局的比较 102
7.3.1 使用Force Atlas 布局 103
7.3.2 使用Force Atlas 2 布局 103
7.3.3 使用Fruchterman Reingold 布局 104
7.3.4 使用OpenOrd 布局 105
7.3.5 使用Yifan Hu 布局 105
7.3.6 使用Yifan Hu 比例布局 106
第8 章 过滤 107
8.1 过滤的操作界面 108
8.1.1 4 个与过滤有关的工具 109
8.1.2 过滤的分类选择工具 110
8.1.3 过滤的查询工具 110
8.2 过滤的使用方法 111
8.2.1 动态 111
8.2.2 属性 112
8.2.3 拓扑 117
8.2.4 操作分类 137
8.2.5 边 145
第9 章 统计 151
9.1 统计的界面 152
9.2 统计的运行方式 156
9.3 统计的介绍 161
9.3.1 网络概述 161
9.3.2 节点概述 183
9.3.3 边概述 185
9.3.4 动态 188
第10 章 Gephi 的预览界面 193
10.1 预览显示区操作区域 194
10.2 预览显示区底部工具区域 194
10.3 预览设置区底部工具区域 195
10.4 预览设置区操作区域 199
第11 章 Gephi 的颜色选取工具 203
11.1 Choose a Color 204
11.1.1 HSB 205
11.1.2 RGB 211
11.1.3 Hex 212
11.2 节点、边、标签的颜色设置 213
11.3 颜色渐变选取条 216
11.3.1 渐变选取的作用 216
11.3.2 颜色定义点的添加与删除 217
11.3.3 颜色定义点颜色的选取 218
11.4 分区 219
11.5 多选项卡的颜色选取框 220
第12 章 Gephi 空间坐标 222
12.1 Gephi 的X、Y、Z 空间坐标 223
12.2 编辑节点的坐标 224
第13 章 CSV 与Gephi 227
13.1 什么是CSV 228
13.2 从什么地方可以得到CSV 229
13.3 创建一个CSV 文件导入到Gephi 229
13.4 举例:创建“西游记爱慕关系CSV 数据”并导入到Gephi 230
13.4.1 在Excel 中创建节点与边的数据 230
13.4.2 导出为CSV 文件 231
13.4.3 导入到Gephi 中 232
13.5 Gephi 对特殊格式的CSV 文件的支持 235
13.5.1 特殊格式一 236
13.5.2 特殊格式二 237
13.5.3 特殊格式三 237
13.6 Gephi 对矩阵形式的CSV 文件的支持 238
第14 章 动态图 240
14.1 用动态图实现两个例子 241
14.1.1 例子1——生命 241
14.1.2 例子2——婚姻关系 241
14.2 Gephi 动态数据的特性 242
14.3 编辑节点和边的动态数据 243
14.3.1 生命数据的编辑 243
14.3.2 婚姻数据的编辑 244
14.4 动态展示 245
14.4.1 基本展示方法 245
14.4.2 动态数据设置方法 246
第15 章 Gephi 的插件管理 248
15.1 旧版Gephi 商店介绍 249
15.2 新版Gephi 商店介绍 254
15.3 Gephi 插件管理程序 255
第16 章 Gephi 编程 259
16.1 参与Gephi 开发 260
16.1.1 获取Gephi 源代码 260
16.1.2 编译Gephi 源代码 266
16.1.3 修改Gephi 源代码 268
16.2 开发 Gephi 插件 269
16.2.1 Gephi 源代码概述 269
16.2.2 开发一个Gephi 布局插件 271
16.3 Gephi Toolkit 279
16.3.1 Gephi Toolkit 介绍 279
16.3.2 使用Gephi Toolkit 开发自己的图应用程序 280
附录A 代码 286
附录B 为Gephi 提供算法基础的论文 296
媒体评论
 ;  ; 在这本书中,你会得到很多帮助,例如安装指南、界面组成、插件安装、各种不同类型文件的介绍(GEXF,CSV 等)。还可以学到Gephi 的很多高级特性,例如动态网络和如何使用 Gephi Toolkit。更为重要的是,这本书详细介绍了 Gephi 对网络分析的核心步骤的支持:如何使用布局算法,如何通过过滤网络来解释数据,如何合理地利用诸如PageRank 或中心性等统计方法。Gephi 对你来说不再是一个黑盒子,它是一个探索工具。因此一定要理解这个道理:Gephi 不同的特性能帮助你更深入地掌握你的数据。
 ;  ; 这本书可以帮助中文读者建立一个数据可视化的扎实基础,但是我更希望读者掌握技能后能够思考如何应对更普遍的问题,也就是面对一个大数据的世界,如何成为未来的首席数据官(CDO)。在未来我们需要更多的首席数据官,因为任何社会过程都必须针对数据开展。而如果我们不能掌握利用数据的方法和规律,将很快陷入与机器竞赛处理能力的怪圈中。相反,如果我们可以透过数据看到比机器处理的更多含义,人类本身的价值就会保持得更长久。
很高兴看到刘勇与来自中国科学院计算机网络信息中心的数据可视化专家杜一通力协作,在 Gephi 软件创始人 Mathieu Jacomy 的支持下,出版了关于 Gephi 的专著。在过去的几年中,刘勇与杜一投入了大量的时间,推动 Gephi 在国内的普及,比如刘勇开设网站,展现各种精美的Gephi数据可视化图表,激发人们的学习兴趣,还开设课程,帮助新手尽快上手 Gephi ;杜一则为 Gephi 写过一款采集Twitter数据的插件。他们是当之无愧的Gephi专家。相信这本书将帮助你快速了解并掌握Gephi。本书介绍了Gephi的历史,并以图文并茂的方式讲解了 Gephi 的安装和各种操作流程,还扩展了 Gephi 的一些高阶技巧。
前沿
2007 年我在巴黎人文科学中心1 工作的时候开发了Gephi 的第一个版本。那时我是实验室里唯一的一名工程师,与我合作的是像Dana Diminescu2 一样的社会学家。当时我们遇到了一个问题,我们想从互联网上收集一些特定领域的信息,并对它们进行分析和可视化。但是我们没有找到合适的工具来帮助我们完成这个任务。因此,我们决定自己开发这样一个工具。这听上去有些疯狂,但我们对这个新的挑战都充满热情!
- 通过GitHub提交问题:https://github.com/ooof/Gephi/issues/。
- 通过邮件提交问题:digitip gephi@gmail.com。
如果想了解更多我们关于Gephi 的信息,可以浏览以下网站。
- Gephi开放研究网络:http://gephi.strikingly.com/。
- Gephi G 页面:https://plus.google.com/u/0/ 105972204587241689146。
- Gephi中文教程:https://www.udemy.com/gephi。
- 数据可视化开放发布:https://dvop.github.io/。
@jacomyma
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